托雷基亚携诺亚返回之后又开启了没日没夜的研究。
托雷基亚手下的军团却肆无忌惮地开始扩张，借助托雷基亚所开辟的宇宙通道，在众多宇宙中纵横，占领了多片星域。
其手下军团实力也在不断提升。
宇宙警备队派遣出多名战士协助其他星域反抗托雷基亚军团的入侵，但效果依旧不佳，多片星域落入到了托雷基亚的手中。
黑暗扎基依旧在特利伽宇宙中流浪，寻找着戴拿与德凯的踪迹，而他的追杀令也从未撤销。
麦克斯奥特曼所占据的古兰星系经历了多次大规模进攻，损失惨重，但依旧能够勉强扎稳脚跟。
麦克斯的根据地虽然逐渐缩小，但他的旗帜便也如同一道烈火，带领着特利伽宇宙的战士们奋进反抗。
时间过了两百年，在遥远的宇宙中，某片不知名星域内爆发了一场惊天大战，战争持续数日之久。
没有人知道交战双方是谁，没有人知道战争的起因亦或者是过程。
战争过后那片星域变成了一片荒域，再无生机可言。
时间又过了两百年。
德拉西翁不再退居幕后，毅然入世。
德拉西翁率领恩多拉机械军团占领多片星域。
托雷基亚大军同时扩张到了光之国所在的主宇宙。
光之国所在宇宙中，佐菲率队亲自坐镇在托雷基亚设置的宇宙传送门处，暂时可以与托雷基亚军团相抗衡。
但这种抗衡阶段只持续了数年，几年之后。
随着托雷基亚的实验室一阵爆破声起，实验室轰然湮灭，托雷基亚放声呼啸。
托雷基亚不再一心扎在研究当中，而是亲自出手追杀黑暗扎基，但黑暗扎基的行踪神秘异常，每次出现都在宇宙不同的角落，即使是托雷基亚的能量，竟然也无法寻找到他。
除此之外，在托雷基亚出关之时，托雷基亚军团实力瞬间上升一个层次。
主宇宙中托雷基亚军团指数型上涨，宇宙警备队败退，最终退回m78星云。
托雷基亚大军力量即将压境。
梦比优斯奥特曼突然出现在宇宙传送门处，七进七出，轻伤杀回光之国，临危接任宇宙警备队队长一职。
宇宙警备队实力大涨。
将托雷基亚军团主体逼退数万星系，保住了宇宙反抗军的最高旗帜。
光之国自此由战略防御阶段转为战略相持阶段。
此时，整片大宇宙已经有五成星域处在托雷基亚的掌控之中，三成星域被德拉西翁所占领。
光之国的宇宙警备队勉强守护住自己的主宇宙，另在其他部分星域设有守军依旧苦苦支撑。
麦克斯军团身受埋伏，深陷包围。
托雷基亚奥特曼亲自带队要将麦克斯军团一网打尽。
关键时刻，雷杰多奥特曼出手，两人大战数日。
最后雷杰多被迫解体为杰斯提斯奥特曼和高斯奥特曼。
托雷基亚退军。
麦克斯反抗军再次缩回古兰星系。
时间又再次过去了三百年，赛罗依旧没有出现。
整个大宇宙处在水深火热之中。
奥特之王败了。
诺亚败了。
雷杰多败了。
宇宙已经完完全全沦为了托雷基亚的玩物，就像他说的那样，成为了他一个人的实验室。
阴影笼罩在世人头上。
自那场大战已经过去一千年。
赛罗之名。
还流传在宇宙之中。
有很多人相信着他最后一定会出现带领着所有人取得真真正正的胜利。
但，已经没有多少人再去相信他还活着了。
……
“一千年了。”
麦克斯站在古兰星系的边缘处，他的背后黑暗巴尔坦星人，泰迦奥特曼站在身旁。
麦克斯奥特曼摇了摇头，随即开口问道：“杰斯提斯呢？”
“螺旋星系的守军发来求救，你当时不在，杰斯提斯带领了一部分人前去支援。”黑暗巴尔坦星人回答道。
麦克斯奥特曼点了点头。
“多派点人，让欧布也过去，泰迦，你也跟着去看一下吧，萨诺星系已经完全没有消息传来了，恐怕已经完全沦陷了，或者完全失去了通信能力，我去那里看一看。我不在的时候，由高斯接替指挥。”
泰迦奥特曼点了点头。
黑暗巴尔坦星人说道：“那里太危险了，不如还是让我去吧，你如果倒下了，我们的旗帜就倒了半截。”
“有你在，你就是另一面旗帜。”
麦克斯奥特曼拍了拍黑暗巴尔坦星人的肩膀，随即化作流光向着远方而去。
泰迦奥特曼望着麦克斯奥特曼离去的方向，不由得喃喃道：“赛罗哥哥，一千年了，你为什么还不回来，宇宙需要你，所有人都需要你……”
泰迦叹了口气，而后纵身跃起化作流光。
……
某处偏远星域内，一颗荒凉的星球群山之中。
黑暗扎基的身影猛然在群山之中闪现，而后向上飞翔，一拳攻破两只飞翔魔兽之后，又再次身影消失在群山之中。
黑暗扎基站在地面，看向群星，神情复杂。
“一千年……赛罗你这家伙，还要等到什么时候……”
忽然之间。
黑暗扎基的猩红色双眼忽然一阵闪动。
他站在原地好一会儿。
而后停止下来低下头。
随即身影消失在原地。
这颗星球的另一面，某个森林遗迹宫殿中，黑暗扎基的身躯缓缓浮现。
他的面前站立着帝纳斯奥特曼。
“帝纳斯，快来。泽塔传来消息，找到德凯的下落了！”
“真的吗？”帝纳斯的眼中发出光亮。
“没错，根据泽塔的得来的消息，德凯出现在了一个名叫螺旋星系的地方。”扎基开口说道。
“太好了！”
扎基揉了揉帝纳斯的头，“嗯，一千年了，总算是有一些收获。”
“只是太辛苦你了，这些年真是太危险了，如果不是我，你一个人……”
扎基打断她说话，“说这些干什么？说实在的，我们能活到现在，还真是多亏了泽塔。”
“嗯，要不是泽塔，只怕我们八百年前就死在那次围剿当中了。”
“这宇宙，还能清明吗？”
“会的，他会回来的，我们一定能等到他回来的那一天……不说那些了，走！带你去螺旋星系。”
黑暗扎基将帝纳斯横着抱起。
“我说过很多次啦，我自己能飞。”
扎基哈哈大笑，“都一样啦！”
两人化作流光向着某个方向冲去。