李遂,字邦良,丰城段潭人。弱冠之年,跟从欧阳德学习,考取进士,授官行人,历刑部郎中,时锦衣卫送来强盗十三人,李遂只用一人抵罪,其他的都被他分辨释放。确立新太子时,皇上大赦天下,李遂请求将“大礼”大案诸臣都列在赦令中,尚书聂贤恐惧不敢,于是和同官一起向都御史王廷相求问,王廷相听凭他们这样做,事情虽然没有成功,但议者赞美他。不久他调到礼部,因忤逆尚书夏言,事情遭到弹劾而下诏狱,被贬任湖州同知。
李遂三迁衢州知府,注重风化治理,闲暇时喜欢招友讲学。处州民饥,李遂聚集众人入境采矿,与推官李文进轻骑直逼矿山,饥民焚寨而逃,封矿而归。章圣皇后灵柩南运,风传取道常山,指令衢州备车轿迎送。遂三次上书谓梓宫无由取道衢州。上司震怒掷书于地,催逼急如星火,遂不动声色,后果如所料。浙中各郡县为此敛财物役百姓,怨声四起,唯独衢州上下安然。治衢任内,盗贼敛迹,财赋充裕,百姓感戴。后提升为苏、松兵备副使,又逐渐升职为广东按察使,在位期间释放囚徒八百多人。进官山东右布政使。江洋多盗贼,于是迁右佥都御史提督操江。军政严明,盗不敢发。
俺答侵犯京师,召李遂督苏州军饷,他没有向皇上谢恩,就请求关防验符用新的官衔,世宗皇帝恼怒,削去他的官籍。倭寇侵扰江北,朝廷讨论说因督漕都御史兼理巡抚,没有时间对付敌寇,请求特别设置巡抚,于是命李遂用原官身份巡抚凤阳四府。当时淮、扬三次遭受倭寇侵掠,这一年又发大水,而且天天役使人民拉大木运送到京师。李遂请求增加粮饷增加兵士,抚恤黎民节省开支,这些措施都是为了战、守作打算。
倭寇舰船数百艘犯海门,为了防止倭寇由泰州逼长天、凤阳、泗州,进犯明皇室寝陵,又为了防止倭寇由黄桥逼瓜洲、仪征,进犯南京,梗塞粮道,李遂设计逼使倭寇由富安沿海窜至庙湾,使之陷于绝地而歼之。于是,命副使刘景韶、游击丘升扼守如阜,而亲自驰兵泰州,当其要冲。乘势而来的倭寇见如阜有备,立即转攻泰州。李遂急命刘景韶、丘升出击,连战丁堰、海安、通州皆捷。
倭寇只得沿海北上,李遂喜曰:“贼无能为矣!”遂令刘景韶、丘升尾追倭寇,将其驱赶至庙湾。李遂又虑倭寇窜入淮安,星夜驰入淮安城。不久,倭寇果至,李遂督参将曹克新御之于姚家荡。此时,右通政唐顺之闻倭寇犯江北,急令总兵官卢镗拒敌于崇明,自率副总兵刘显驰援李遂,与李遂一同大败倭寇于姚家荡,倭寇退至庙湾立寨固守。与此同时,刘景韶亦大败倭寇于印庄,追至新河口,焚斩甚众。接着也会兵庙湾,庙湾之敌负隅顽抗,李遂主张列围而困之,唐顺之以为非计,率兵逼近敌寨以火攻之,不能克。
此时,拒敌崇明的卢镗连连告急,唐顺之只得回援崇明,李遂围困倭寇于庙湾一月有余,乃令刘景韶塞堑攻寨,火焚其舟。倭寇乘雨夜逃遁。李遂追敌至虫段子港,斩杀甚众。唐顺之回师崇明,督卢镗、刘显进击倭巢,一再失利。正值盛暑,唐顺之居舟两月,辛劳染疾,返回太仓。崇明倭寇乘机流窜江北,欲犯扬州。刘景韶连战连胜,围之于刘庄,会刘显来援,李遂传命诸军尽归刘显指挥,攻破其巢,追至白驹场,全歼倭寇。于是江北倭患悉平。
不久,在江东代替张鏊任尚书。江北池河营的士兵因为千户吴钦革除他们的帮丁,就殴打吴钦并将他缚在竿子上。帮丁是操练防守士兵的每人给一丁兵饷,以资往来费用。李遂已被召封为兵部左侍郎,因言官推荐而提升为南京参赞尚书,由他来镇压安抚。营卒被妖僧绣头所惑,又散布流言。李遂将绣头捕住杀掉,再三向队伍申严纪律,书写军士的姓名籍贯,年龄相貌,系牌腰间,军士才止息。因多次督兵抗倭,屡立战功,迁南京兵部右侍郎,未几,进南京兵部尚书。
衢州父老感思德政,于城北李遂原讲学处塑李遂铜像,重约2000斤,并建李公遗爱祠,祠及碑均列入省二级文物保护单位。
李遂,博学多智,长于用兵,但也善于逢迎,皇帝准备重新建造三殿,李遂奏说五河县泗水中涌现大杉一棵,这是川泽效灵,为助圣主鼎新革故,皇帝大喜。李遂又进献白兔,皇帝为此派遣官员告于宗庙,从此皇帝更加宠爱李遂。以老致仕,辞官归隐,卒年六十三,赠太子太保,谥号襄敏,着作有《督抚经略疏》等。